1890年
京師武備學校：陸軍軍官、士官學校，後併入帝國陸軍大學。
南苑炮兵學校：陸軍專業炮兵軍官、士官學校，後併入帝國陸軍大學。
保定陸軍學院：原保定講武學堂，直隸軍區的陸軍軍官、士官學院。
京師同文學院：原京師同文館，培養軍事外語人才。
陸軍醫學院：設在京師。
1891年
帝國軍事情報學院：設在京師北郊，培養軍事情報人員。
馬尾海軍學院：原馬尾水師學堂，海軍軍官學院。
帝國陸軍大學：主校區在京郊豐臺，江寧有分校區，陸軍軍官大學。
帝國海軍大學：主校區在天津，大連和上海有分校區，海軍軍官大學。
帝國狙擊學校：設在保定，陸軍專業士官學校。
承德騎兵學校：騎兵專業士官、軍官學院。
1892年
帝國參謀學院：設在京師南郊，陸海軍參謀軍官學院，中高級指揮參謀人才的再培訓基地。
京師禁衛步兵學校：陸軍士官學校，禁衛教導旅駐地。
北洋海軍技術學院：設在天津，培養海軍技術士官、軍官。
濟南炮兵學校：陸軍專業士官學校。
海軍醫學院：設在天津。
1893年
帝國軍事科技學院：設在京師，總參謀部直轄，培養軍事科技人員。
帝國聯勤學院：設在江寧，培養後勤士官、軍官。
濟南陸軍學院：華東軍區的士官、軍官學院。
奉天陸軍學院：東北軍區的陸軍士官、軍官學校。
1894年
廣州海軍學院：海軍軍官、士官學院。
桂林陸軍學院：西南軍區的陸軍士官、軍官學院。
蘭州陸軍學院：西北軍區的士官、軍官學院。
武昌陸軍學院：原武昌講武學堂，華南軍區的士官、軍官學院。